ראש השב"כ לשעבר יובל דיסק, הכניס את ראשו למחלוקת הבחירות סביב בחירת הרב הראשי לירושלים, והביע התנגדות למועמדותו של הרב שמואל אליהו, רבה של העיר צפת.
דיסקין, שהיה ממונה בעבר על שירות הביטחון הכללי במדינת ישראל, חושש כי הרב הראשי בבירה יהיה מי שלזכותו עומדות שלל "אמירות קיצוניות", כלשונו, "נגד ערבים, נוצרים" ויהודים העושים כמעשה ארץ מצרים.
דיסקין לא הסתפק בהבעת התנגדו, ואף קרא לראש העיר ניר ברקת וליועץ המשפטי לממשלה, שיפסלו את מינוי הרב אליהו לתפקיד, ואף קרא לציבור להצטרף למחאתו.
גם כאשר התמודד הרב שמואל אליהו על תפקיד הרבנות הראשית לישראל, נרדף הרב אליהו בידי גורמים שונים בשל פסיקותיו ההלכתיות.
מה הדיסקין הזה מתערב בכלל??? 1 כ"ו תשרי תשע"ה 16:31 אוהבים תמיד את הרב שמואל!